Se trata de uno de los primeros museos en su tipo en América Latina y, por su temática específica, está catalogado como un museo de ciencia y tecnología, compartiendo las mismas características con museos de Rusia, Estados Unidos y Canadá.

Fue fundado originalmente por la empresa YPF (Yacimientos Petrolíferos Fiscales), el 13 de diciembre de 1987, para evitar “que se pierdan en el tiempo los testimonios de las luchas y sacrificios de quienes con encomiable espíritu patriótico, defendieron y preservaron para la nación la riqueza que brotara de la entraña misma del desierto, aquel histórico y distante 13 de diciembre de 1907”. Durante el año 1993, debido a la privatización de la empresa, fue transferido a la Universidad Nacional de la Patagonia San Juan Bosco, dependiendo actualmente de la Secretaría de Ciencia y Técnica de esta institución, transformándose en uno de los pocos museos universitarios de Argentina.